С того же автовокзала еще можно сесть в маршрутку Пежо, их там называют "сервиис" (ударение на длинном "и"). Если поторговаться - за 30-35 фунтей в Каир уехать вроде можно.
Самый дорогой и быстрый способ - из Хургады в Каир летает то ли один то ли два рейса в день. Стоит больше 100 баков в один конец.