На основе собственного опыта могу сказать, что можно и то, и др. (при условии, что босоножки на реально плоской подошве и при карабкании на склон/со склона вам удобно в них наступать).
Дело в том, что в Луксор я ездила в босоножках, а в Каир в кроссовках :) Проблем не было ни в одном из случаев.